تستخدم الطباعة الفلكسوغرافية بشكل أساسي 3 فئات رئيسية من الأحبار: الحبر المائي، والحبر القائم على المذيبات، والحبر المعالج بالأشعة فوق البنفسجية/LED؛ أما حبر EB والحبر الحيوي فهما خياران متخصصان.

يشار إلى الحبر المائي باختصار بالحبر المائي. الفرق الرئيسي بين الحبر المائي والحبر الزيتي هو الاختلاف في المذيب. يستخدم الحبر ذو الأساس المائي الماء (45٪ -50٪) كمذيب ، ومحتوى المركبات العضوية المتطايرة منخفض للغاية ، والذي يحتوي على القليل من التلوث البيئي: يستخدم الحبر ذو الأساس الزيتي المذيبات العضوية (التولوين ، دي تولوين ، الكحول المحوَّل الصفات ، إلخ.) كمذيب. في صناعة التعبئة والتغليف المرنة ، نظرًا لأن الأحبار القائمة على المذيبات متطايرة وجافة بشكل أساسي ، فكلما انخفضت نقطة غليان المذيب ، كان من الأسهل تطاير الغازات السيئة وإطلاقها لتلوث البيئة. بعد اكتمال الطباعة ، توجد أيضًا بقايا سيئة على السطح. المواد ، في حين أن المذيبات المستخدمة في الأحبار المائية هي الماء والإيثانول المستبعدة من قائمة صوت ، والتي يمكن أن تقلل بشكل ممتاز انبعاثات صوت .